Jonathan Ruiz ha decidido dejar la Ponferradina tras nueve temporadas consecutivas defendiendo los colores blanquiazules, nueve temporadas donde el jugador de Écija, localidad donde nació un 2 de abril de 1982 y que ocupaba la demarcación de centrocampista, lo dejó todo sobre el terreno de juego, a la vez que era un jugador muy querido por la afición pues valoraban su comportamiento y rendimiento, a la vez que una educación y amabilidad exquisita.

Por eso decimos anteriormente que Jonathan Ruiz es de ese tipo de jugadores que dejan huella y que por lo tanto su baja será difícil de cubrir, pero el andaluz decidió ir con la familia para su tierra y ante eso nada se puede hacer. Lo que si queremos es a través de El Bierzo Digital es agradecerle lo mucho que hizo en la Ponferradina y desearle, si decide seguir jugando en algún equipo, la mejor de las suertes, pues Jonathan Ruiz lo merece.

Antes de recalar en la SD Ponferradina  Jonathan Ruiz jugó en el Écija las temporadas 2000-01, 2001-02, y 2002-03, todas ellas en Segunda División B, así como en el Sevilla B, también de Segunda División B, las temporadas 2003-04, 2004-05, 2005-06, 2006-07, así como en la Segunda División A en la temporada 2007-08.

En la Ponferradina recaló en la temporada 2008-09 de Segunda División B, misma categoría que en la 2009-10. En la 2010-11 llega el primer ascenso de la historia a la Segunda División A. La Deportiva no mantuvo la categoría y de nuevo jugó en la Segunda División B la campaña 2011-12, consiguiendo de nuevo el ascenso a Segunda División A.

Las temporadas 2012-13, 2013-14, 2014-15 y 2015-16 militó en la Segunda División A. El punto y final de Jonathan Ruiz en la Ponferradina lo pondría en la temporada que acaba de finalizar, la 2016-17, temporada para olvidar al no conseguir su equipo disputar la fase de ascenso.